保证洁净室内
洁净度其中重要一个因素就是压差控制，利用压差隔离控制洁净室不受污染隔离相邻或外界的环境是必须的。正压洁净室通过其内部压差高于外界环境保证外界污染
不能侵入所受控环境之内，而生物安全实验室（存在有生物危险的实验室）则通过负压控制室内污染不会侵入外界环境之中。常用压差控制方法，基本有静态控制及
动态控制两大类，其采用的概念各是：
静态控制
适用于排风不变或至少一段时期内不变的情况下。可以说绝大部分洁净室是静态控制压差的，而当门开启时，压差不能维持，出现空气的相互交换与温差有关，常用
对策是设缓冲室（气闸室），另外一种情况是允许暂时的空气的相互交换，不会影响产品质量等则可不设缓冲室（例如要求洁净度较低的环境）。
适用于排风量变化的情况下。一般是由传感器根据室内设定压力自动调节新风量，以达到所要求之压差值。通常，宜以室内压差的维持来控制新风量（压差传感
器），也有较特殊的环境使用开口风速气流传感器进行压力调节；这种动态控制典型的是高风险度的生物安全实验室，当该实验室内开启生物安全柜等排风设备时，就需要通风新风量自动控制室内压力状态。
